Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
YY1P25490 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YY1P25490 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YY1P25490 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YY1P25490 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YY1P25490 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YY1P25490 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YY1P25490 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YY1P25490 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YY1P25490 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
YY1P25490 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YY1P25490 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YY1P25490 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YY1P25490 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YY1P25490 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YY1P25490 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YY1P25490 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YY1P25490 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YY1P25490 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YY1P25490 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
YY1P25490 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YY1P25490 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YY1P25490 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YY1P25490 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YY1P25490 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YY1P25490 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YY1P25490 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YY1P25490 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YY1P25490 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YY1P25490 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YY1P25490 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YY1P25490 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YY1P25490 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YY1P25490 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YY1P25490 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
YY1P25490 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
YY1P25490 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YY1P25490 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YY1P25490 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YY1P25490 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
YY1P25490 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
YY1P25490 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
YY1P25490 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YY1P25490 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YY1P25490 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YY1P25490 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YY1P25490 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YY1P25490 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YY1P25490 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YY1P25490 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YY1P25490 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
YY1P25490 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YY1P25490 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YY1P25490 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YY1P25490 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YY1P25490 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YY1P25490 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YY1P25490 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YY1P25490 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YY1P25490 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
YY1P25490 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YY1P25490 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YY1P25490 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YY1P25490 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YY1P25490 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YY1P25490 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YY1P25490 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YY1P25490 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
YY1P25490 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YY1P25490 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YY1P25490 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms