Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B4P23634 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP2B4P23634 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B4P23634 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B4P23634 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms