Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF4P23510 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF4P23510 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms