Protein–RNA interactions for Protein: P20908

COL5A1, Collagen alpha-1(V) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1P20908 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL5A1P20908 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL5A1P20908 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms