Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRHP20396 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TRHP20396 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRHP20396 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRHP20396 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRHP20396 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRHP20396 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TRHP20396 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TRHP20396 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRHP20396 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRHP20396 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRHP20396 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRHP20396 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRHP20396 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRHP20396 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRHP20396 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRHP20396 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRHP20396 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRHP20396 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRHP20396 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRHP20396 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRHP20396 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRHP20396 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRHP20396 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRHP20396 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRHP20396 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRHP20396 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRHP20396 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRHP20396 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRHP20396 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRHP20396 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRHP20396 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TRHP20396 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRHP20396 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TRHP20396 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRHP20396 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRHP20396 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRHP20396 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRHP20396 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRHP20396 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRHP20396 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRHP20396 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRHP20396 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRHP20396 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRHP20396 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRHP20396 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRHP20396 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRHP20396 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRHP20396 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRHP20396 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TRHP20396 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRHP20396 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TRHP20396 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRHP20396 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRHP20396 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRHP20396 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRHP20396 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRHP20396 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
TRHP20396 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRHP20396 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRHP20396 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
TRHP20396 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRHP20396 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRHP20396 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRHP20396 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRHP20396 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRHP20396 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TRHP20396 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TRHP20396 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRHP20396 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRHP20396 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRHP20396 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRHP20396 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRHP20396 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRHP20396 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRHP20396 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRHP20396 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TRHP20396 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRHP20396 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRHP20396 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRHP20396 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRHP20396 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRHP20396 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRHP20396 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRHP20396 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TRHP20396 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRHP20396 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRHP20396 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRHP20396 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TRHP20396 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TRHP20396 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRHP20396 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms