Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6P18850 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6P18850 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6P18850 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6P18850 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6P18850 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6P18850 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6P18850 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6P18850 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6P18850 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6P18850 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6P18850 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6P18850 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6P18850 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF6P18850 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF6P18850 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6P18850 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6P18850 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6P18850 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6P18850 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6P18850 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6P18850 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6P18850 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6P18850 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6P18850 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF6P18850 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF6P18850 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF6P18850 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF6P18850 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6P18850 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6P18850 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6P18850 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF6P18850 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF6P18850 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF6P18850 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms