Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL17P18621 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL17P18621 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL17P18621 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL17P18621 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL17P18621 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL17P18621 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL17P18621 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RPL17P18621 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17P18621 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17P18621 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17P18621 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17P18621 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17P18621 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17P18621 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17P18621 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17P18621 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17P18621 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17P18621 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17P18621 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17P18621 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17P18621 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17P18621 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17P18621 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17P18621 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17P18621 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17P18621 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17P18621 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17P18621 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17P18621 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL17P18621 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL17P18621 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL17P18621 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL17P18621 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms