Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR1P18146 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR1P18146 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR1P18146 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR1P18146 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR1P18146 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR1P18146 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR1P18146 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR1P18146 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR1P18146 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR1P18146 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR1P18146 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR1P18146 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR1P18146 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR1P18146 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR1P18146 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR1P18146 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR1P18146 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR1P18146 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR1P18146 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR1P18146 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR1P18146 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR1P18146 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EGR1P18146 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EGR1P18146 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EGR1P18146 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EGR1P18146 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EGR1P18146 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EGR1P18146 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EGR1P18146 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms