Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT1P17948 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT1P17948 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FLT1P17948 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FLT1P17948 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT1P17948 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT1P17948 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FLT1P17948 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FLT1P17948 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT1P17948 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT1P17948 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT1P17948 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT1P17948 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT1P17948 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT1P17948 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT1P17948 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FLT1P17948 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT1P17948 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT1P17948 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT1P17948 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FLT1P17948 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT1P17948 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT1P17948 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT1P17948 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT1P17948 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT1P17948 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT1P17948 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT1P17948 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FLT1P17948 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FLT1P17948 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FLT1P17948 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FLT1P17948 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FLT1P17948 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FLT1P17948 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FLT1P17948 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FLT1P17948 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FLT1P17948 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FLT1P17948 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FLT1P17948 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FLT1P17948 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FLT1P17948 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FLT1P17948 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FLT1P17948 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FLT1P17948 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FLT1P17948 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FLT1P17948 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FLT1P17948 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FLT1P17948 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FLT1P17948 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FLT1P17948 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FLT1P17948 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FLT1P17948 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FLT1P17948 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FLT1P17948 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FLT1P17948 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FLT1P17948 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLT1P17948 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLT1P17948 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLT1P17948 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FLT1P17948 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms