Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2A2P16615 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms