Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GSPT1P15170 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms