Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX6A1P12074 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COX6A1P12074 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX6A1P12074 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX6A1P12074 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX6A1P12074 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
COX6A1P12074 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COX6A1P12074 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms