Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOP08100 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOP08100 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOP08100 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOP08100 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOP08100 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOP08100 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOP08100 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOP08100 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOP08100 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOP08100 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOP08100 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOP08100 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOP08100 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOP08100 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOP08100 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOP08100 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOP08100 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOP08100 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOP08100 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOP08100 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOP08100 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOP08100 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOP08100 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOP08100 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOP08100 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOP08100 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOP08100 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOP08100 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOP08100 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOP08100 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOP08100 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOP08100 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOP08100 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOP08100 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOP08100 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOP08100 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOP08100 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOP08100 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOP08100 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOP08100 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOP08100 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOP08100 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms