Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLK3P07288 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLK3P07288 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLK3P07288 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLK3P07288 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLK3P07288 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLK3P07288 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLK3P07288 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLK3P07288 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLK3P07288 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLK3P07288 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLK3P07288 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLK3P07288 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLK3P07288 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLK3P07288 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLK3P07288 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLK3P07288 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLK3P07288 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLK3P07288 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLK3P07288 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLK3P07288 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLK3P07288 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLK3P07288 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLK3P07288 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLK3P07288 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLK3P07288 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLK3P07288 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLK3P07288 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLK3P07288 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLK3P07288 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLK3P07288 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLK3P07288 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLK3P07288 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLK3P07288 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLK3P07288 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLK3P07288 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLK3P07288 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLK3P07288 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLK3P07288 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLK3P07288 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLK3P07288 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLK3P07288 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLK3P07288 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLK3P07288 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms