Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN1P04843 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPN1P04843 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPN1P04843 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPN1P04843 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPN1P04843 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN1P04843 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN1P04843 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN1P04843 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN1P04843 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN1P04843 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN1P04843 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN1P04843 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN1P04843 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN1P04843 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN1P04843 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPN1P04843 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPN1P04843 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPN1P04843 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPN1P04843 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPN1P04843 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPN1P04843 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN1P04843 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN1P04843 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN1P04843 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN1P04843 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN1P04843 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN1P04843 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN1P04843 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN1P04843 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN1P04843 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPN1P04843 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms