Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F2P00734 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
F2P00734 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F2P00734 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
F2P00734 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
F2P00734 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
F2P00734 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
F2P00734 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
F2P00734 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
F2P00734 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
F2P00734 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
F2P00734 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
F2P00734 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
F2P00734 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
F2P00734 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
F2P00734 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F2P00734 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
F2P00734 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F2P00734 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
F2P00734 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
F2P00734 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F2P00734 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F2P00734 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
F2P00734 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
F2P00734 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F2P00734 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F2P00734 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
F2P00734 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F2P00734 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F2P00734 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F2P00734 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F2P00734 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F2P00734 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F2P00734 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F2P00734 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F2P00734 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F2P00734 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F2P00734 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F2P00734 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F2P00734 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F2P00734 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms