Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX7O95931 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX7O95931 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CBX7O95931 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX7O95931 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX7O95931 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX7O95931 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX7O95931 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX7O95931 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX7O95931 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX7O95931 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX7O95931 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX7O95931 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX7O95931 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX7O95931 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CBX7O95931 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX7O95931 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX7O95931 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX7O95931 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX7O95931 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX7O95931 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX7O95931 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX7O95931 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms