Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYF2O95926 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYF2O95926 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYF2O95926 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYF2O95926 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYF2O95926 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYF2O95926 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYF2O95926 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYF2O95926 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYF2O95926 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYF2O95926 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYF2O95926 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYF2O95926 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYF2O95926 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYF2O95926 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYF2O95926 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYF2O95926 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYF2O95926 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYF2O95926 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYF2O95926 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYF2O95926 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYF2O95926 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYF2O95926 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYF2O95926 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYF2O95926 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYF2O95926 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYF2O95926 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYF2O95926 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYF2O95926 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYF2O95926 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYF2O95926 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYF2O95926 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYF2O95926 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYF2O95926 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYF2O95926 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYF2O95926 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYF2O95926 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYF2O95926 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYF2O95926 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYF2O95926 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYF2O95926 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYF2O95926 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYF2O95926 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYF2O95926 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYF2O95926 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SYF2O95926 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms