Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN7O95471 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms