Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UFL1O94874 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UFL1O94874 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UFL1O94874 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UFL1O94874 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UFL1O94874 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UFL1O94874 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UFL1O94874 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
UFL1O94874 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
UFL1O94874 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UFL1O94874 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UFL1O94874 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UFL1O94874 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UFL1O94874 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UFL1O94874 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UFL1O94874 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UFL1O94874 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UFL1O94874 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UFL1O94874 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UFL1O94874 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UFL1O94874 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UFL1O94874 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UFL1O94874 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UFL1O94874 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UFL1O94874 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UFL1O94874 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UFL1O94874 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UFL1O94874 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UFL1O94874 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UFL1O94874 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UFL1O94874 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UFL1O94874 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UFL1O94874 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UFL1O94874 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UFL1O94874 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UFL1O94874 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UFL1O94874 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UFL1O94874 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms