Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR5O75473 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LGR5O75473 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR5O75473 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR5O75473 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR5O75473 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR5O75473 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR5O75473 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR5O75473 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR5O75473 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR5O75473 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR5O75473 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR5O75473 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR5O75473 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR5O75473 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR5O75473 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR5O75473 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR5O75473 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR5O75473 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR5O75473 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LGR5O75473 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LGR5O75473 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LGR5O75473 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGR5O75473 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LGR5O75473 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGR5O75473 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LGR5O75473 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGR5O75473 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGR5O75473 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGR5O75473 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGR5O75473 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGR5O75473 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGR5O75473 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGR5O75473 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGR5O75473 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGR5O75473 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGR5O75473 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGR5O75473 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LGR5O75473 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms