Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GADD45BO75293 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms