Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC3O43617 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3O43617 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms