Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERI3O43414 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERI3O43414 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERI3O43414 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERI3O43414 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERI3O43414 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERI3O43414 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERI3O43414 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERI3O43414 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms