Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN3O15232 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN3O15232 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN3O15232 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN3O15232 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN3O15232 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN3O15232 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN3O15232 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN3O15232 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN3O15232 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN3O15232 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN3O15232 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN3O15232 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN3O15232 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MATN3O15232 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MATN3O15232 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MATN3O15232 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MATN3O15232 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MATN3O15232 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN3O15232 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN3O15232 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN3O15232 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN3O15232 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN3O15232 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN3O15232 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN3O15232 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN3O15232 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN3O15232 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN3O15232 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN3O15232 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN3O15232 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN3O15232 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN3O15232 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN3O15232 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN3O15232 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN3O15232 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN3O15232 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN3O15232 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN3O15232 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN3O15232 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN3O15232 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN3O15232 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN3O15232 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN3O15232 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN3O15232 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms