Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2LO15068 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2LO15068 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms