Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYNMO15061 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYNMO15061 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYNMO15061 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYNMO15061 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYNMO15061 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNMO15061 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNMO15061 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNMO15061 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNMO15061 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNMO15061 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNMO15061 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNMO15061 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNMO15061 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNMO15061 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNMO15061 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SYNMO15061 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
SYNMO15061 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SYNMO15061 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNMO15061 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNMO15061 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNMO15061 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNMO15061 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNMO15061 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNMO15061 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNMO15061 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNMO15061 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNMO15061 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNMO15061 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNMO15061 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNMO15061 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNMO15061 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNMO15061 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNMO15061 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNMO15061 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNMO15061 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNMO15061 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNMO15061 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNMO15061 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNMO15061 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNMO15061 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNMO15061 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNMO15061 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNMO15061 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNMO15061 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNMO15061 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNMO15061 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNMO15061 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNMO15061 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNMO15061 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNMO15061 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNMO15061 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNMO15061 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNMO15061 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNMO15061 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNMO15061 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNMO15061 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNMO15061 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNMO15061 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNMO15061 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNMO15061 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNMO15061 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNMO15061 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNMO15061 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNMO15061 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNMO15061 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNMO15061 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNMO15061 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms