Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR3AO14802 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR3AO14802 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR3AO14802 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR3AO14802 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR3AO14802 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR3AO14802 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR3AO14802 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR3AO14802 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR3AO14802 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
POLR3AO14802 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR3AO14802 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms