Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHDO14521 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHDO14521 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHDO14521 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHDO14521 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHDO14521 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHDO14521 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHDO14521 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHDO14521 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHDO14521 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHDO14521 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDHDO14521 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDHDO14521 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDHDO14521 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDHDO14521 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHDO14521 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHDO14521 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHDO14521 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHDO14521 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHDO14521 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHDO14521 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHDO14521 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHDO14521 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHDO14521 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHDO14521 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHDO14521 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHDO14521 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHDO14521 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHDO14521 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHDO14521 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHDO14521 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHDO14521 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHDO14521 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms