Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAPO00193 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAPO00193 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAPO00193 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAPO00193 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAPO00193 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAPO00193 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAPO00193 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAPO00193 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAPO00193 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAPO00193 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAPO00193 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAPO00193 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAPO00193 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAPO00193 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAPO00193 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAPO00193 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAPO00193 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAPO00193 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAPO00193 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAPO00193 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAPO00193 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAPO00193 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAPO00193 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAPO00193 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAPO00193 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAPO00193 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAPO00193 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAPO00193 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAPO00193 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAPO00193 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAPO00193 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAPO00193 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAPO00193 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAPO00193 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAPO00193 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAPO00193 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAPO00193 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAPO00193 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAPO00193 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAPO00193 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAPO00193 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAPO00193 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAPO00193 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAPO00193 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAPO00193 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms