Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1W4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1W4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
H7C1W4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
H7C1W4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
H7C1W4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
H7C1W4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1W4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1W4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1W4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1W4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1W4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1W4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1W4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1W4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1W4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1W4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1W4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1W4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1W4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1W4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1W4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1W4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1W4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1W4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1W4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1W4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1W4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1W4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1W4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1W4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1W4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1W4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1W4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1W4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1W4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1W4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1W4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1W4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1W4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1W4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
H7C1W4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
H7C1W4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
H7C1W4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1W4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1W4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1W4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1W4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1W4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1W4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1W4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1W4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1W4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1W4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1W4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1W4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1W4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1W4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1W4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1W4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1W4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1W4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms