Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc62E9PVD1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc62E9PVD1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc62E9PVD1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms