Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC85CA6NKD9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85CA6NKD9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms