Protein–RNA interactions for Protein: A6NHX0

CASTOR2, Cytosolic arginine sensor for mTORC1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTOR2A6NHX0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTOR2A6NHX0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTOR2A6NHX0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTOR2A6NHX0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms