Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNDIG1LA6NDD5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNDIG1LA6NDD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms