Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP17L3A6NCW0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L3A6NCW0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms