Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC26A0AVF1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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