Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms