Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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