Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIFKQ9BYG3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms