Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms