Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms