Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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