Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms