Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms