Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms