Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 VOPP1-208ENST00000433959 2900 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RANBP20P-201ENST00000557256 2104 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 WEE2-AS1-206ENST00000478332 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 C16orf82-202ENST00000505035 2459 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM105-201ENST00000332900 3321 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms