Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms