Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms