Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL24A1Q17RW2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL24A1Q17RW2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL24A1Q17RW2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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COL24A1Q17RW2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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COL24A1Q17RW2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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COL24A1Q17RW2 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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